রাজাপুর ইউনিয়নে একটি নদী একটি সাগর ও একটি খাল রয়েছে। ইউনিয়নের পূর্ব পাশ দিয়ে বয়ে গেছে যমুনা নদী ও পশ্চিম পাশ দিয়ে বয়ে গেছে হুরা সাগর, এবং ইউনিয়নের মধ্যস্থানে রয়েছে একটি খাল। খালটি খাপছির খাল হিসেবে এ ইউনিয়নে পরিচিত।
Planning and Implementation: Cabinet Division, A2I, BCC, DoICT and BASIS